MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 4865

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009928	CAAGTA	2	12	224434	224445	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158340395
4002	NC_009928	TGA	2	6	224502	224507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340395
4003	NC_009928	CATT	2	8	224508	224515	25 %	50 %	0 %	25 %	158340395
4004	NC_009928	AG	3	6	224564	224569	50 %	0 %	50 %	0 %	158340395
4005	NC_009928	CAT	2	6	224577	224582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340395
4006	NC_009928	TGACA	2	10	224586	224595	40 %	20 %	20 %	20 %	158340395
4007	NC_009928	GAA	2	6	224611	224616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340395
4008	NC_009928	TG	3	6	224742	224747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_009928	AGG	2	6	224776	224781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340396
4010	NC_009928	AAC	2	6	224792	224797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340396
4011	NC_009928	CTTTT	2	10	224834	224843	0 %	80 %	0 %	20 %	158340396
4012	NC_009928	ATC	2	6	224849	224854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340396
4013	NC_009928	TTTAT	2	10	224858	224867	20 %	80 %	0 %	0 %	158340396
4014	NC_009928	TAC	2	6	224932	224937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_009928	ATCA	2	8	224942	224949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4016	NC_009928	TC	3	6	225050	225055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4017	NC_009928	CAAGGA	2	12	225067	225078	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4018	NC_009928	CAAGAC	2	12	225144	225155	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_009928	TA	3	6	225233	225238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_009928	CCT	2	6	225281	225286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340397
4021	NC_009928	GA	3	6	225351	225356	50 %	0 %	50 %	0 %	158340397
4022	NC_009928	GCC	2	6	225464	225469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340397
4023	NC_009928	TTGG	2	8	225495	225502	0 %	50 %	50 %	0 %	158340397
4024	NC_009928	ACC	2	6	225508	225513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340397
4025	NC_009928	GCT	2	6	225562	225567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340397
4026	NC_009928	GTT	2	6	225682	225687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340397
4027	NC_009928	TCA	2	6	225770	225775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_009928	TCAT	2	8	225777	225784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_009928	ATC	2	6	225834	225839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_009928	CAA	2	6	225942	225947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340398
4031	NC_009928	CGAC	2	8	225974	225981	25 %	0 %	25 %	50 %	158340398
4032	NC_009928	AGA	2	6	225989	225994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340398
4033	NC_009928	TCA	2	6	226031	226036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340398
4034	NC_009928	CTC	2	6	226062	226067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340398
4035	NC_009928	CTTAG	2	10	226287	226296	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4036	NC_009928	GGT	2	6	226360	226365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_009928	GCA	2	6	226383	226388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_009928	CAC	2	6	226500	226505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_009928	AGC	2	6	226513	226518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_009928	TCA	2	6	226519	226524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_009928	GA	3	6	226584	226589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_009928	CAT	2	6	226595	226600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_009928	AGA	2	6	226607	226612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_009928	AGCA	2	8	226678	226685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_009928	CT	3	6	226716	226721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_009928	ACC	2	6	226725	226730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_009928	AG	3	6	226802	226807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_009928	AC	4	8	226889	226896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_009928	TTG	2	6	227005	227010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340399
4050	NC_009928	TGCTG	2	10	227076	227085	0 %	40 %	40 %	20 %	158340399
4051	NC_009928	TCG	2	6	227144	227149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340399
4052	NC_009928	AAC	2	6	227165	227170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340399
4053	NC_009928	ATC	2	6	227239	227244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340399
4054	NC_009928	GTC	2	6	227261	227266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340399
4055	NC_009928	AAG	2	6	227284	227289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340399
4056	NC_009928	TGA	2	6	227294	227299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340399
4057	NC_009928	TCAGC	2	10	227423	227432	20 %	20 %	20 %	40 %	158340399
4058	NC_009928	CAG	2	6	227483	227488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340399
4059	NC_009928	GGAT	2	8	227501	227508	25 %	25 %	50 %	0 %	158340399
4060	NC_009928	TTA	2	6	227512	227517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340399
4061	NC_009928	CCT	2	6	227678	227683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340399
4062	NC_009928	CGC	2	6	227746	227751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340399
4063	NC_009928	CCAT	2	8	227846	227853	25 %	25 %	0 %	50 %	158340399
4064	NC_009928	CGT	2	6	227875	227880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340399
4065	NC_009928	AAT	2	6	227917	227922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340399
4066	NC_009928	GAG	2	6	228034	228039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340399
4067	NC_009928	TACC	2	8	228057	228064	25 %	25 %	0 %	50 %	158340399
4068	NC_009928	CGG	2	6	228112	228117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340399
4069	NC_009928	CAA	2	6	228156	228161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340399
4070	NC_009928	AGC	2	6	228164	228169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340399
4071	NC_009928	CAC	2	6	228255	228260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340399
4072	NC_009928	AC	3	6	228371	228376	50 %	0 %	0 %	50 %	158340399
4073	NC_009928	CAAC	2	8	228483	228490	50 %	0 %	0 %	50 %	158340399
4074	NC_009928	GAAACT	2	12	228516	228527	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158340399
4075	NC_009928	TCC	2	6	228547	228552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340399
4076	NC_009928	AGG	2	6	228671	228676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340399
4077	NC_009928	TTG	2	6	228703	228708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340399
4078	NC_009928	TTG	2	6	228807	228812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_009928	TC	3	6	228882	228887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4080	NC_009928	AG	3	6	228912	228917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_009928	CCT	2	6	228961	228966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_009928	TTG	2	6	229002	229007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_009928	C	7	7	229015	229021	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4084	NC_009928	AG	3	6	229084	229089	50 %	0 %	50 %	0 %	158340400
4085	NC_009928	CGA	2	6	229173	229178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340400
4086	NC_009928	AGC	2	6	229194	229199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340400
4087	NC_009928	AGT	2	6	229219	229224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340400
4088	NC_009928	AGT	2	6	229255	229260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340400
4089	NC_009928	CA	3	6	229270	229275	50 %	0 %	0 %	50 %	158340400
4090	NC_009928	ACT	2	6	229287	229292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340400
4091	NC_009928	CAA	2	6	229511	229516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340400
4092	NC_009928	TCT	2	6	229593	229598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340400
4093	NC_009928	AAT	2	6	229637	229642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340400
4094	NC_009928	TCG	2	6	229761	229766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340400
4095	NC_009928	AGA	2	6	229824	229829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340400
4096	NC_009928	GAA	2	6	229889	229894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340400
4097	NC_009928	CAT	2	6	229966	229971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340400
4098	NC_009928	ACT	2	6	230061	230066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340400
4099	NC_009928	TCCA	2	8	230252	230259	25 %	25 %	0 %	50 %	158340400
4100	NC_009928	GTG	2	6	230297	230302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340400
4101	NC_009928	CTC	2	6	230321	230326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340400
4102	NC_009928	GAT	2	6	230329	230334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340400
4103	NC_009928	ACT	2	6	230467	230472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340401
4104	NC_009928	TCC	2	6	230508	230513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340401
4105	NC_009928	TGC	2	6	230528	230533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340401
4106	NC_009928	GAG	2	6	230549	230554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340401
4107	NC_009928	CCT	2	6	230746	230751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_009928	TGGC	2	8	231060	231067	0 %	25 %	50 %	25 %	158340402
4109	NC_009928	TCG	2	6	231076	231081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340402
4110	NC_009928	A	7	7	231103	231109	100 %	0 %	0 %	0 %	158340402
4111	NC_009928	GAC	2	6	231218	231223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340402
4112	NC_009928	GCC	2	6	231303	231308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340402
4113	NC_009928	GA	3	6	231348	231353	50 %	0 %	50 %	0 %	158340402
4114	NC_009928	CTG	2	6	231373	231378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340402
4115	NC_009928	CTT	2	6	231382	231387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340402
4116	NC_009928	GTT	2	6	231471	231476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_009928	ACCAC	2	10	231510	231519	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4118	NC_009928	TTAA	2	8	231532	231539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_009928	ACG	2	6	231574	231579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_009928	TCA	2	6	231604	231609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_009928	ATT	2	6	231644	231649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_009928	AATA	2	8	231650	231657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_009928	ATG	3	9	231780	231788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340403
4124	NC_009928	AG	3	6	231811	231816	50 %	0 %	50 %	0 %	158340403
4125	NC_009928	CAT	2	6	231856	231861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340403
4126	NC_009928	GAT	2	6	231872	231877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340403
4127	NC_009928	GCG	2	6	231911	231916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340403
4128	NC_009928	AGTT	2	8	231921	231928	25 %	50 %	25 %	0 %	158340403
4129	NC_009928	GAA	2	6	232106	232111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340403
4130	NC_009928	GGA	2	6	232117	232122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340403
4131	NC_009928	GAA	2	6	232149	232154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_009928	TTG	2	6	232228	232233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340404
4133	NC_009928	ACCA	2	8	232246	232253	50 %	0 %	0 %	50 %	158340404
4134	NC_009928	GAT	3	9	232263	232271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340404
4135	NC_009928	CAAA	2	8	232528	232535	75 %	0 %	0 %	25 %	158340404
4136	NC_009928	CAA	2	6	232581	232586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340404
4137	NC_009928	TCA	2	6	232852	232857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4138	NC_009928	ATA	2	6	232862	232867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_009928	TGC	2	6	232922	232927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4140	NC_009928	TCA	3	9	232958	232966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4141	NC_009928	GGA	2	6	232967	232972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_009928	TGA	2	6	232978	232983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340405
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4153	NC_009928	CT	3	6	233802	233807	0 %	50 %	0 %	50 %	158340408
4154	NC_009928	C	6	6	233967	233972	0 %	0 %	0 %	100 %	158340408
4155	NC_009928	A	6	6	234024	234029	100 %	0 %	0 %	0 %	158340408
4156	NC_009928	AATT	2	8	234066	234073	50 %	50 %	0 %	0 %	158340408
4157	NC_009928	GAA	2	6	234120	234125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340409
4158	NC_009928	A	6	6	234130	234135	100 %	0 %	0 %	0 %	158340409
4159	NC_009928	GAA	2	6	234202	234207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340409
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4165	NC_009928	A	6	6	234513	234518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_009928	TCT	2	6	234534	234539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4167	NC_009928	AAAT	2	8	234626	234633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4168	NC_009928	TAG	2	6	234698	234703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340410
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4173	NC_009928	G	7	7	235095	235101	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4174	NC_009928	TAC	2	6	235143	235148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340411
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4182	NC_009928	TGG	2	6	235429	235434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340411
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4195	NC_009928	AGTC	2	8	236133	236140	25 %	25 %	25 %	25 %	158340412
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4200	NC_009928	GTCT	2	8	236428	236435	0 %	50 %	25 %	25 %	158340412
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4204	NC_009928	ATCC	2	8	236713	236720	25 %	25 %	0 %	50 %	158340412
4205	NC_009928	CATG	2	8	236874	236881	25 %	25 %	25 %	25 %	158340413
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4217	NC_009928	TAA	2	6	237667	237672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4218	NC_009928	ATC	2	6	237832	237837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4220	NC_009928	CTG	2	6	237861	237866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4221	NC_009928	GAG	2	6	237935	237940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4222	NC_009928	TGGA	2	8	237962	237969	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4223	NC_009928	AATC	2	8	238009	238016	50 %	25 %	0 %	25 %	158340414
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4228	NC_009928	GGCA	2	8	238219	238226	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4229	NC_009928	T	7	7	238243	238249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4230	NC_009928	AGAA	2	8	238280	238287	75 %	0 %	25 %	0 %	158340415
4231	NC_009928	ACAGC	2	10	238294	238303	40 %	0 %	20 %	40 %	158340415
4232	NC_009928	T	7	7	238332	238338	0 %	100 %	0 %	0 %	158340415
4233	NC_009928	GT	3	6	238504	238509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_009928	ACC	2	6	238612	238617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4235	NC_009928	GTT	2	6	238644	238649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340416
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4237	NC_009928	GAATG	2	10	238672	238681	40 %	20 %	40 %	0 %	158340416
4238	NC_009928	AGT	2	6	238720	238725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340416
4239	NC_009928	GT	3	6	238741	238746	0 %	50 %	50 %	0 %	158340416
4240	NC_009928	TGA	2	6	238748	238753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340416
4241	NC_009928	CCAA	2	8	238836	238843	50 %	0 %	0 %	50 %	158340416
4242	NC_009928	TC	4	8	238892	238899	0 %	50 %	0 %	50 %	158340416
4243	NC_009928	GAA	2	6	238919	238924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340416
4244	NC_009928	A	6	6	239032	239037	100 %	0 %	0 %	0 %	158340416
4245	NC_009928	CTC	2	6	239059	239064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340416
4246	NC_009928	AC	3	6	239080	239085	50 %	0 %	0 %	50 %	158340416
4247	NC_009928	ACT	2	6	239156	239161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4248	NC_009928	TTGT	2	8	239331	239338	0 %	75 %	25 %	0 %	158340417
4249	NC_009928	CTA	2	6	239395	239400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340417
4250	NC_009928	ATG	2	6	239408	239413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340417
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4252	NC_009928	TTTTC	2	10	239486	239495	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4259	NC_009928	GTG	2	6	239823	239828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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